More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1846 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
268 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
270 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.13 
 
 
269 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  44.04 
 
 
271 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
271 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
305 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
281 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
269 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
266 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
286 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
268 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
287 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28998  predicted protein  32.88 
 
 
283 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  29.93 
 
 
365 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
349 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  35.59 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  34.3 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.61 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  34.3 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  36.79 
 
 
320 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  34.87 
 
 
311 aa  92.4  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  33.21 
 
 
257 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05368  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00440)  32.72 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  31.09 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
253 aa  89  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  31.09 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
327 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.74 
 
 
301 aa  87  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.12 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10815  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.4 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.93 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000294024 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.48 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
248 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.44 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  30 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.81 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10494  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  33.82 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  29.38 
 
 
267 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  31.98 
 
 
254 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
247 aa  79  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
240 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>