More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2266 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 268 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.78 
 
 		 268 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28998  predicted protein  34.72 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  29.67 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.7 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  28.21 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  26.67 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.1 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.45 
 
 		 292 aa  99  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  31.65 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 320 aa  95.5  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  31.98 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 341 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  27.8 
 
 		 309 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  27.46 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  31.31 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  28.45 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  35.2 
 
 		 320 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 		 316 aa  92.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.3 
 
 		 307 aa  92  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 312 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  30.65 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.57 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 300 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.12 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 298 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 305 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  30.81 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  30.48 
 
 		 308 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  34.71 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.47 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  34.01 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0363  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.14 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  30.1 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2241  putative short chain dehydrogenase  30.37 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 315 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 316 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 341 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>