More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0868 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
282 aa  567  1e-161  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
290 aa  268  8e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
288 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.36 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
292 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
286 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
285 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
281 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
284 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  36.92 
 
 
598 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
326 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
279 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
287 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
289 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
297 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
288 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
284 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
277 aa  135  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
304 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  33.1 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
326 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  29.58 
 
 
300 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  28.87 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
303 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0363  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.9 
 
 
273 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177062  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  36.4 
 
 
272 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.22 
 
 
312 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
288 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  33.9 
 
 
304 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 
305 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
271 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
273 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  34.28 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
298 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
298 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
298 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
311 aa  118  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.05 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.05 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
306 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
315 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  34.71 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  34.05 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.5 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
297 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
269 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
312 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  31.06 
 
 
301 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
327 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
269 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
305 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
307 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  33.56 
 
 
305 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  29.66 
 
 
316 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30.15 
 
 
309 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
292 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00870669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
304 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  31 
 
 
306 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
305 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
266 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
309 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.16 
 
 
309 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
278 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
301 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.91 
 
 
328 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  30.24 
 
 
321 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
296 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271715  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
280 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  27.27 
 
 
311 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
290 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  29.5 
 
 
309 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4520  predicted protein  30.15 
 
 
330 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.645511  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
295 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  29.95 
 
 
309 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>