More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5261 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.64 
 
 
278 aa  567  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.03 
 
 
279 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09140  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  55.72 
 
 
272 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.334901 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.99 
 
 
273 aa  264  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00939747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  51.66 
 
 
274 aa  256  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7223  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.75 
 
 
274 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.28 
 
 
278 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.207273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
287 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
276 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
288 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.685413  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 
292 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
284 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.26 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
281 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
326 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
286 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
288 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
292 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
285 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
349 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0363  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.87 
 
 
273 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.177062  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
312 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
271 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
282 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.178945  normal  0.215411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
300 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
312 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  36.45 
 
 
352 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
307 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  35.05 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
300 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
300 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
300 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  36.63 
 
 
306 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
289 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 
305 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
290 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.82 
 
 
309 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.48 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.14 
 
 
284 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  30 
 
 
309 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
298 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  34.74 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  30.48 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.9 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
304 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
290 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
317 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
267 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0478741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
280 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  32.88 
 
 
333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  32.88 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
316 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
312 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
268 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
326 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1955  putative short-chain dehydrogenase  31.23 
 
 
598 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00955158  hitchhiker  0.00174251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
308 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  31.27 
 
 
296 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 
276 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
319 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
314 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  33.89 
 
 
292 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 
299 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
340 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>