More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0729 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  100 
 
 
308 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  95.3 
 
 
300 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  61.28 
 
 
311 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  62.16 
 
 
300 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  51.85 
 
 
301 aa  338  9e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  53.06 
 
 
302 aa  321  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  53.51 
 
 
309 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  54.33 
 
 
309 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  53.63 
 
 
309 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  51.49 
 
 
309 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
312 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
315 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
324 aa  239  5e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
317 aa  235  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
301 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 
316 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  40.14 
 
 
304 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
326 aa  222  4.9999999999999996e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
307 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.74 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  38.74 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  38.74 
 
 
329 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.99 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 
311 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.34 
 
 
305 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
305 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
303 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 
299 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
301 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
310 aa  203  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
305 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  40.14 
 
 
302 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
298 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
307 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
303 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  37.41 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
300 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
298 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
298 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
304 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
306 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
328 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
306 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
303 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
320 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
306 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.67 
 
 
328 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
306 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 
298 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
317 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 
312 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  37.41 
 
 
306 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
305 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
319 aa  185  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
288 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
327 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
312 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
328 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
298 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
290 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  38.54 
 
 
309 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
309 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
305 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  38.23 
 
 
309 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
313 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
297 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
312 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
301 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
320 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
301 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
301 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
324 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
288 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  35.15 
 
 
308 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
303 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  37.3 
 
 
321 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  34.53 
 
 
312 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
306 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  34.35 
 
 
320 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 
314 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
317 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  37.86 
 
 
319 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  35.35 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
335 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
306 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
314 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  33.67 
 
 
318 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
315 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
328 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>