More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_15620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  100 
 
 		 320 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  66.25 
 
 		 319 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  69.16 
 
 		 321 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.77 
 
 		 315 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  64.8 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  65.53 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  65.53 
 
 		 321 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  61.25 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.56 
 
 		 318 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  54.75 
 
 		 320 aa  318  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.03 
 
 		 325 aa  311  9e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.46 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 		 332 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.69 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.09 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.84 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.91 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 341 aa  268  8e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  47.38 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 341 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 		 331 aa  255  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.89 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  43.12 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.1 
 
 		 312 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.12 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  39.33 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.44 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  39.73 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  40.26 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  34.35 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 		 306 aa  159  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  34.01 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  34.91 
 
 		 661 aa  156  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  38.54 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.74 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  43.07 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 		 290 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.87 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  39.32 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.97 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  39.07 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.92 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.42 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  37.42 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  37.42 
 
 		 329 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  32.77 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  35.59 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>