More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2559 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
339 aa  700    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
343 aa  286  4e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
341 aa  278  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
341 aa  276  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
340 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
339 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  43.24 
 
 
320 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
333 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
324 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
341 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
324 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 
331 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
331 aa  252  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
331 aa  252  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  41.89 
 
 
320 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
339 aa  251  9.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
332 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  39.23 
 
 
321 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  41.47 
 
 
319 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  37.46 
 
 
321 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  41.59 
 
 
318 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
315 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
331 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
318 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  37.46 
 
 
321 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  37.46 
 
 
321 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 
335 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
328 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
325 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
322 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
320 aa  183  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
313 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  34.62 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
326 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 
338 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
310 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  30.18 
 
 
329 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
318 aa  163  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 
325 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
326 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
326 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 
313 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 
312 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
307 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
307 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
316 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.75 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
327 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  28.92 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  30.75 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
300 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  31.56 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  30.41 
 
 
300 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.66 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  32.84 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  26.79 
 
 
661 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
312 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  36.45 
 
 
302 aa  125  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.94 
 
 
328 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
326 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
320 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 
312 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  29.84 
 
 
309 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
309 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.73 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
241 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  28.44 
 
 
300 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
317 aa  119  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
328 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  38.58 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  30.03 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
298 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.21 
 
 
302 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  27.88 
 
 
312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  34.33 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  27.61 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.61 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.67 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.05 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>