More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5387 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
341 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.29 
 
 
341 aa  540  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
339 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 
341 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
339 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.71 
 
 
343 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
331 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
331 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.41 
 
 
331 aa  371  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
340 aa  358  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.31 
 
 
324 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.69 
 
 
324 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.49 
 
 
332 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
328 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.41 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
318 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  48.77 
 
 
321 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  48 
 
 
320 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  47.24 
 
 
319 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  48.16 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  48.47 
 
 
321 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  48.47 
 
 
321 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  47.24 
 
 
320 aa  268  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
315 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 
339 aa  261  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  44.79 
 
 
318 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
320 aa  225  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
325 aa  222  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  41.74 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
322 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
323 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
313 aa  215  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  38.74 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 
327 aa  212  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
318 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
325 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
326 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
313 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
310 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
312 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 
307 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
300 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
317 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
312 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
307 aa  153  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
316 aa  152  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 
304 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 
298 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
336 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  33.53 
 
 
661 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
312 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
305 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
315 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 
241 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
301 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
298 aa  142  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
303 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  34.14 
 
 
303 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.99 
 
 
290 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.78 
 
 
284 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 
320 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  34.33 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
312 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
299 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
309 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
310 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  37.42 
 
 
309 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
324 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.49 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
327 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  41.94 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  36.53 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  33.13 
 
 
311 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  34.42 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.74 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.84 
 
 
328 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
320 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>