More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3314 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 320 aa  650    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.68 
 
 		 323 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.93 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.38 
 
 		 325 aa  461  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.23 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.94 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  68.31 
 
 		 329 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.33 
 
 		 327 aa  411  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  45.89 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 		 339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.37 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 331 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  45.71 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 340 aa  235  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  44.79 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.85 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  43.85 
 
 		 321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.61 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 341 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.65 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.38 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  42.64 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  39.06 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  44.48 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  44.48 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 325 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 		 326 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.84 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 316 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  40.13 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  40.19 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 		 297 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  39.81 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  39.81 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.24 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  37.66 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  46.45 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  40.79 
 
 		 306 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  49.52 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  38.44 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.12 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  39.05 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  40.09 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.94 
 
 		 284 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  35.63 
 
 		 661 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.59 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>