More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0326 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 325 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.54 
 
 		 326 aa  531  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.38 
 
 		 323 aa  484  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  70.77 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.38 
 
 		 320 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.52 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.92 
 
 		 322 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.08 
 
 		 320 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 		 340 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  44 
 
 		 324 aa  232  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.27 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.22 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 341 aa  225  6e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 		 333 aa  225  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  42.77 
 
 		 319 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  44.51 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  42.54 
 
 		 320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.73 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.05 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  43.21 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 331 aa  219  7e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.06 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  42.9 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 341 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 313 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 		 326 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  42.28 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  42.28 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 		 312 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 		 297 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.23 
 
 		 288 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 312 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 		 298 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  47.14 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  36.62 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  36.01 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  36.01 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 306 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  42.44 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  34.6 
 
 		 661 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  39.31 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  40.06 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  33.33 
 
 		 284 aa  143  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  44.5 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  35.6 
 
 		 292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  42.79 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  38.54 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>