More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0686 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  100 
 
 
324 aa  661    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  50 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  49.39 
 
 
321 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.69 
 
 
315 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.74 
 
 
313 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  47.38 
 
 
320 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.55 
 
 
325 aa  263  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 
318 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  48.63 
 
 
321 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.31 
 
 
324 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  45 
 
 
318 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  48.94 
 
 
321 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  48.94 
 
 
321 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 
312 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
318 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
332 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
335 aa  232  7.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 
313 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.26 
 
 
333 aa  228  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
340 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
343 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 
310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.45 
 
 
328 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
320 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
339 aa  216  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
326 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
326 aa  212  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  41.67 
 
 
320 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
331 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
327 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
339 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
341 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
341 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
322 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  42.64 
 
 
329 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
331 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
313 aa  205  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
331 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
331 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.62 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 
316 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
312 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
307 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
297 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 
300 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
301 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  37.54 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  34.74 
 
 
661 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
305 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
327 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
307 aa  143  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.58 
 
 
305 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 
317 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  35.08 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
288 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  35.81 
 
 
300 aa  139  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
310 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
298 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  43.72 
 
 
303 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
241 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
289 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.67 
 
 
328 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
303 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
290 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  41.26 
 
 
304 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
298 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 
306 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 
306 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
308 aa  133  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 
306 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
312 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  38.46 
 
 
302 aa  129  6e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  33.75 
 
 
320 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
298 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>