More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4584 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 338 aa  681    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.64 
 
 		 313 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.22 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.94 
 
 		 340 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 		 324 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 		 328 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  42.63 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 		 341 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  43.73 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  45.16 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  41.16 
 
 		 320 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  41.56 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.04 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  42.45 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  43.83 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  43.83 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 331 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.75 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  49.76 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.1 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  40.51 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  38.28 
 
 		 661 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  49.03 
 
 		 300 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.76 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  40.87 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  40.13 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  51.2 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.87 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  41.21 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  40.39 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 		 298 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  47.85 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  48.8 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 		 329 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  38.93 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  38.93 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.09 
 
 		 298 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.8 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.77 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.76 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  43.35 
 
 		 302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.57 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 		 305 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 		 305 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.51 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  40.59 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>