More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2134 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 		 329 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  99.7 
 
 		 333 aa  673    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  99.7 
 
 		 329 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  93.62 
 
 		 328 aa  622  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.06 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.75 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.75 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.7 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.23 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  60.78 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  60.46 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.44 
 
 		 312 aa  319  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  50.82 
 
 		 316 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.62 
 
 		 301 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.83 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 		 305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  46.93 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  46.93 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  46.93 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.98 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  48.03 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  47.06 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  48.52 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 301 aa  245  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  46.41 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  44.41 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.23 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  43.96 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  45.64 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.4 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  46.2 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  40.6 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.24 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.83 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 289 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  39.8 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  39.6 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  38.59 
 
 		 309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  38.74 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  44.04 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 		 306 aa  212  9e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  46.05 
 
 		 299 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  38.26 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  38.26 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 314 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  46.67 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  42.67 
 
 		 306 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.37 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.41 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  43.42 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.08 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 312 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  40.2 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>