More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2120 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
313 aa  634    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  82.64 
 
 
338 aa  501  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
324 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
325 aa  242  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.05 
 
 
324 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
327 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.31 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
340 aa  232  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
320 aa  231  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
326 aa  231  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
326 aa  230  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  44.55 
 
 
319 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  43.93 
 
 
329 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
328 aa  228  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.97 
 
 
323 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
341 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
322 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.45 
 
 
320 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  44.01 
 
 
321 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
332 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
343 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  40.86 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  39.63 
 
 
324 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  42.48 
 
 
321 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
339 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
341 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
313 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  42.48 
 
 
321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  42.48 
 
 
321 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 
315 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
331 aa  205  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
331 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
313 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 
316 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 
312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.66 
 
 
339 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
331 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  39.81 
 
 
318 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
310 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  38.82 
 
 
661 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
326 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
307 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  47.32 
 
 
300 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.23 
 
 
312 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  51.38 
 
 
303 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  39.93 
 
 
300 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 
300 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  46.83 
 
 
300 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 
307 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  47.37 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  46.41 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
297 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 
312 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
298 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
306 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
319 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
306 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
306 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 
305 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
324 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 
302 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.17 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
326 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  44.98 
 
 
304 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 
298 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.75 
 
 
328 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  43.86 
 
 
305 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
290 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.54 
 
 
320 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
304 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
288 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
315 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 
306 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  37.7 
 
 
302 aa  159  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
298 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
287 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
289 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
289 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
289 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
314 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.31 
 
 
301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
305 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  36.12 
 
 
333 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  36.12 
 
 
329 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
292 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.12 
 
 
329 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
303 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
336 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>