More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1049 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 326 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.54 
 
 		 325 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  70.77 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.23 
 
 		 323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.23 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.78 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.15 
 
 		 322 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.69 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 324 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.3 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 		 313 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.56 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  42.32 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.48 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  44.03 
 
 		 319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  42.25 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  43.79 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  39.94 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  42.55 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.14 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.14 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  41.61 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  41.61 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  35.8 
 
 		 661 aa  163  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.24 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 298 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 		 297 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 312 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  28.02 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.13 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 300 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  43.41 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.54 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  44.23 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  38.56 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  47.17 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  37.54 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  41.91 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.26 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 314 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  45.89 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>