More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2789 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  100 
 
 
304 aa  604  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  75.99 
 
 
300 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  77.3 
 
 
299 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75 
 
 
298 aa  421  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  70.2 
 
 
303 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  68 
 
 
311 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.1 
 
 
307 aa  391  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  68.21 
 
 
300 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  68.21 
 
 
300 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  68.21 
 
 
300 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  67.77 
 
 
302 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  64.78 
 
 
303 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  64.14 
 
 
306 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  63.82 
 
 
306 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  63.82 
 
 
306 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.61 
 
 
304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  65.25 
 
 
305 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.86 
 
 
298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.52 
 
 
312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  52.82 
 
 
316 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
312 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 
326 aa  268  8e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.81 
 
 
317 aa  267  2e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
324 aa  259  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.03 
 
 
328 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
315 aa  255  5e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.03 
 
 
329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  48.03 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  48.03 
 
 
329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 
312 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
319 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
298 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
298 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.35 
 
 
305 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.49 
 
 
310 aa  240  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.67 
 
 
328 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  50.5 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
328 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
328 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.51 
 
 
306 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.48 
 
 
297 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.55 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  45.67 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  50 
 
 
301 aa  232  5e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  47.32 
 
 
302 aa  231  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 
290 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.85 
 
 
307 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 
306 aa  231  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.67 
 
 
328 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  45.36 
 
 
300 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  47.73 
 
 
317 aa  228  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  41.16 
 
 
300 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
303 aa  227  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.89 
 
 
309 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 
312 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.49 
 
 
306 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  48.03 
 
 
309 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  40.14 
 
 
308 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  41.47 
 
 
311 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.36 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  47.37 
 
 
309 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.02 
 
 
309 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
288 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
288 aa  216  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.51 
 
 
306 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  37.87 
 
 
309 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  46.2 
 
 
308 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  38.33 
 
 
309 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
289 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
289 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.38 
 
 
289 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  38 
 
 
309 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
314 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
324 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  36.79 
 
 
309 aa  205  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  46.08 
 
 
318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
305 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  46.58 
 
 
312 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  46.23 
 
 
320 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
305 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  36.69 
 
 
318 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.59 
 
 
313 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
281 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
314 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
314 aa  186  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
316 aa  182  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.83 
 
 
281 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
316 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
308 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>