More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3909 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 306 aa  594  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.54 
 
 		 306 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  88.89 
 
 		 306 aa  461  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.12 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.81 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.22 
 
 		 314 aa  338  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.98 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  49.19 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.38 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  51.49 
 
 		 304 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  50.17 
 
 		 300 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  46.41 
 
 		 316 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  51.48 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.21 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  49.5 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  48.2 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.68 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  48.05 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  48.05 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.33 
 
 		 298 aa  242  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  48.05 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  46.75 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  49.51 
 
 		 302 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  47.56 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  49.51 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.06 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  47.06 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  47.06 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.06 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.9 
 
 		 301 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  47.85 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.2 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  46.86 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  49.18 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.65 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.67 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 		 306 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.18 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 		 312 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 		 328 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.59 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.68 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.52 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  48.87 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  47.02 
 
 		 302 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  46.53 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.65 
 
 		 306 aa  201  9e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  43.04 
 
 		 316 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  46.51 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 288 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  45.1 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.67 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  36.86 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.49 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  41.28 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  45.31 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 324 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  45.95 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4041  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.138801  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.76 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 		 298 aa  179  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  37.84 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  37.84 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 		 317 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  37.76 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.55 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.981527  normal  0.0865499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3427  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779859  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.18 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  unclonable  0.0000194239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.48 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  36.73 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>