More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0593 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
281 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
288 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.18 
 
 
297 aa  218  7e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 
298 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.77 
 
 
298 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  44.52 
 
 
300 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  43.21 
 
 
304 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
312 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.96 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 
300 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  42.76 
 
 
300 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  42.76 
 
 
300 aa  192  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
305 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
312 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.36 
 
 
324 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.03 
 
 
326 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  44.48 
 
 
303 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.96 
 
 
328 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 
303 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  45.33 
 
 
306 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  42.01 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.29 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 
306 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  44.64 
 
 
306 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  42.46 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
320 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
312 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  44.56 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
316 aa  178  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.66 
 
 
317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  42.61 
 
 
333 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  42.61 
 
 
329 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43 
 
 
307 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.27 
 
 
329 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
328 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
328 aa  175  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
305 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.24 
 
 
307 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  41.72 
 
 
306 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
315 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
328 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
328 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
298 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
319 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
298 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
305 aa  156  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.97 
 
 
309 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  39.51 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
315 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.79 
 
 
317 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
304 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
290 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  35.07 
 
 
300 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  35.54 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
308 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
305 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
325 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  40.14 
 
 
318 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  38.41 
 
 
302 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
314 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  36.91 
 
 
319 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
304 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
338 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
308 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
339 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  43.13 
 
 
320 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
301 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
296 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.271715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  39.73 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  36.49 
 
 
320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
339 aa  132  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  35.86 
 
 
363 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  35.86 
 
 
363 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
318 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.88 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
341 aa  132  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
314 aa  131  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  33.56 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>