More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2701 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  100 
 
 
320 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.2 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.06 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.34 
 
 
340 aa  325  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  54.75 
 
 
320 aa  318  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.8 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  52.22 
 
 
319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  52.26 
 
 
321 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  51.58 
 
 
321 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
332 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.68 
 
 
343 aa  293  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.16 
 
 
318 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.47 
 
 
341 aa  290  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
341 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  52.26 
 
 
321 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  52.26 
 
 
321 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
339 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.34 
 
 
341 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.49 
 
 
328 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.2 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  48.42 
 
 
318 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 
339 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 
339 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.4 
 
 
331 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.87 
 
 
331 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.6 
 
 
318 aa  246  4e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
335 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
310 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  40.94 
 
 
329 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.54 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.77 
 
 
327 aa  219  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
323 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.16 
 
 
338 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  41.67 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
320 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
313 aa  208  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
313 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
326 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
326 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.48 
 
 
313 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
326 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
312 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
316 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
312 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
304 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  39.6 
 
 
300 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
324 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.76 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
326 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  35.56 
 
 
301 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
305 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.81 
 
 
288 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
298 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
307 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
315 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
297 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.45 
 
 
303 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  36.86 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  38 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.12 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
301 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.89 
 
 
308 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.89 
 
 
309 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.44 
 
 
298 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
271 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
312 aa  142  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
288 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  38.91 
 
 
284 aa  142  7e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
305 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  43.22 
 
 
302 aa  142  9e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.13 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.48 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.58 
 
 
309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
320 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.29 
 
 
328 aa  139  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
305 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.15 
 
 
309 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  33.33 
 
 
311 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  33.55 
 
 
300 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 
319 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.16 
 
 
310 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 
305 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>