More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6184 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  100 
 
 
321 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  95.33 
 
 
321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  95.33 
 
 
321 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  86.25 
 
 
321 aa  551  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  67.92 
 
 
319 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  64.8 
 
 
320 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.38 
 
 
318 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.15 
 
 
315 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  59.06 
 
 
318 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.06 
 
 
324 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.69 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.7 
 
 
340 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  52.26 
 
 
320 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.11 
 
 
335 aa  295  6e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
339 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.08 
 
 
332 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.54 
 
 
328 aa  292  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.77 
 
 
341 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.55 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.08 
 
 
343 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 
333 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 
339 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53 
 
 
325 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
331 aa  276  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
341 aa  263  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 
331 aa  261  8.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  48.63 
 
 
324 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
331 aa  255  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
331 aa  246  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
313 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
320 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.2 
 
 
322 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
310 aa  215  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.02 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
327 aa  212  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
312 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.9 
 
 
325 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 
326 aa  209  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
338 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.38 
 
 
326 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  41.93 
 
 
329 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.41 
 
 
318 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 
326 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
323 aa  202  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.48 
 
 
313 aa  202  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.07 
 
 
336 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 
312 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  38.94 
 
 
316 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  37.11 
 
 
301 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
307 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
307 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  39.33 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  35.76 
 
 
661 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
300 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  35.39 
 
 
308 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  35.39 
 
 
300 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  36.03 
 
 
311 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
305 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
305 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.95 
 
 
315 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
301 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  38.31 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  32.52 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
297 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
303 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.45 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  32.11 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.83 
 
 
320 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  32.65 
 
 
309 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 
317 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.14 
 
 
328 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  39.84 
 
 
300 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  39.71 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.45 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.25 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  36.45 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  34.56 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  36.45 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
324 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
307 aa  132  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  34.81 
 
 
284 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>