More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3892 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 331 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.09 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.97 
 
 		 331 aa  536  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.75 
 
 		 339 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.83 
 
 		 339 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.98 
 
 		 343 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.41 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 		 341 aa  354  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.53 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.27 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 		 333 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  43.99 
 
 		 321 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  45.4 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  43.99 
 
 		 319 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  45 
 
 		 318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  44.41 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  41.57 
 
 		 339 aa  252  7e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.85 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 		 315 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.49 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  43.35 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  43.35 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 320 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 325 aa  199  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  35.47 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 338 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  36.89 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  33.12 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 309 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.23 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.44 
 
 		 284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.01 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  33.54 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 315 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  34.42 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  34.84 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.35 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.35 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.35 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  34.06 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 303 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  32.43 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  32.89 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.12 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>