More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36252 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  100 
 
 
320 aa  648    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  39.09 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.39 
 
 
307 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 
300 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
300 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.85 
 
 
300 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
312 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  36.19 
 
 
352 aa  166  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.14 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
317 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 
304 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  39.1 
 
 
306 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
319 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
326 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.19 
 
 
298 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
324 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.03 
 
 
303 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
301 aa  155  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
305 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
299 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
320 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
315 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
318 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  36.98 
 
 
321 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  38.36 
 
 
300 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
303 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
302 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
303 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
297 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
326 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.42 
 
 
313 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
313 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  37.38 
 
 
316 aa  149  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.38 
 
 
305 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  31.63 
 
 
309 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 
290 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
304 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  35.69 
 
 
292 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
289 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
288 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
307 aa  142  9e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
306 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  37.54 
 
 
303 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
312 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
306 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
310 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  35.33 
 
 
329 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.86 
 
 
328 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  31.56 
 
 
309 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
311 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
310 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
308 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
305 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
292 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  34.37 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
341 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
298 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  35.92 
 
 
320 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
304 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.79 
 
 
288 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  34.97 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.9 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.79 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  33.96 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  31.65 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  42.38 
 
 
301 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  42.86 
 
 
302 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
331 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.31 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  34.31 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  34.31 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.07 
 
 
303 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  36.33 
 
 
342 aa  132  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  34.87 
 
 
321 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.37 
 
 
327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  40.57 
 
 
311 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  32.71 
 
 
308 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.75 
 
 
333 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>