More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30578 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  100 
 
 
352 aa  719    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  43.87 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
288 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
288 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.31 
 
 
328 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
326 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  36.19 
 
 
320 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
289 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
289 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
289 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
317 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
297 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 
298 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.64 
 
 
329 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  33.64 
 
 
333 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  33.64 
 
 
329 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
305 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
312 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
287 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
300 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
304 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 
308 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
300 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
300 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
312 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
320 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
298 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
312 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
317 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
301 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
303 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
305 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
306 aa  142  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.72 
 
 
315 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.49 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  34.98 
 
 
319 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
305 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  34.06 
 
 
320 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
298 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
271 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  31.31 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
313 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
306 aa  136  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
315 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
322 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
316 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  42.18 
 
 
300 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  39.45 
 
 
316 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  35.62 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
307 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
304 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
306 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.99 
 
 
279 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  33.44 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
303 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
328 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  37.44 
 
 
311 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  33.23 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  30.82 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
292 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 
308 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
313 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  36.97 
 
 
308 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  33.54 
 
 
302 aa  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  37.38 
 
 
309 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
278 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
278 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
299 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
317 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
312 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
306 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
314 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
278 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>