More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2767 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 327 aa  662    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.35 
 
 		 323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  66.46 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.69 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.33 
 
 		 320 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.05 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.16 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  45.1 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  44.3 
 
 		 320 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.75 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 		 324 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  44.09 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  42.77 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  43.31 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  43.63 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  42.46 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 341 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.34 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  42.22 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  42.22 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 		 335 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 313 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  46.45 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.06 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.5 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.53 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.05 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  46.48 
 
 		 305 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 303 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  44.83 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.03 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  42.5 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  38.56 
 
 		 299 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  46.41 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  43 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  34.15 
 
 		 661 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  44.66 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  38.24 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 289 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  41.18 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.65 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  38.83 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>