More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0945 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
328 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
341 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.6 
 
 
340 aa  331  9e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
341 aa  325  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.03 
 
 
324 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.94 
 
 
332 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.73 
 
 
324 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.15 
 
 
341 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  53.54 
 
 
321 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  53.35 
 
 
321 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
339 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 
343 aa  287  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  51.21 
 
 
319 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  49.09 
 
 
320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
333 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
339 aa  278  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.38 
 
 
331 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
331 aa  275  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  53.85 
 
 
321 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  53.85 
 
 
321 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
331 aa  271  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  48.49 
 
 
320 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.66 
 
 
318 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  48.94 
 
 
318 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.36 
 
 
335 aa  245  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
325 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
338 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
313 aa  222  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  43.45 
 
 
324 aa  219  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.95 
 
 
313 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.94 
 
 
339 aa  205  8e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.63 
 
 
312 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
310 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
327 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
325 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
323 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  38.46 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
322 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.61 
 
 
326 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
307 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  37.66 
 
 
301 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  40.3 
 
 
661 aa  156  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.3 
 
 
241 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  44.7 
 
 
302 aa  152  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
301 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
326 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  38.96 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
303 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.12 
 
 
298 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
289 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
289 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
289 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
292 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 
312 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
287 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
290 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.83 
 
 
312 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  36.28 
 
 
317 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  36.94 
 
 
306 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
312 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.63 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
304 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  35.34 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  42.93 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  34.94 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.84 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.87 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  32.63 
 
 
352 aa  129  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.06 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.91 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  35.94 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  33.2 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
327 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
309 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
280 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.824425  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.99 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
324 aa  126  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
318 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  32.8 
 
 
311 aa  125  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>