More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3484 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
331 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.93 
 
 
339 aa  475  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.76 
 
 
331 aa  449  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
331 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.76 
 
 
331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.09 
 
 
339 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.35 
 
 
341 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.67 
 
 
343 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.43 
 
 
341 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 
340 aa  322  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.53 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.31 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.54 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.38 
 
 
328 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  47.15 
 
 
321 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  45.57 
 
 
321 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  46.84 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  46.84 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  45.57 
 
 
319 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  43.87 
 
 
320 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  45.11 
 
 
320 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.52 
 
 
315 aa  250  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  45.11 
 
 
318 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.89 
 
 
318 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  38.6 
 
 
329 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  41.18 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
335 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.14 
 
 
325 aa  207  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
323 aa  205  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 
326 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
327 aa  202  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.23 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
318 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
326 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
313 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
313 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
313 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.39 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
307 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 
304 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
303 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
327 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
300 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
312 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
316 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  35.44 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
306 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  33.84 
 
 
661 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
317 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
303 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
300 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  36.75 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
309 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
312 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
297 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 
290 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.23 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
298 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 
303 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  33.55 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  34.18 
 
 
302 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.39 
 
 
328 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  33.66 
 
 
318 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
301 aa  126  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
310 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
312 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
287 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
317 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
312 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.07 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  36.4 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
307 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.07 
 
 
333 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.07 
 
 
329 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>