More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5759 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
310 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.24 
 
 
313 aa  324  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.06 
 
 
313 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.75 
 
 
318 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.77 
 
 
326 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
312 aa  281  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.94 
 
 
340 aa  238  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  44.41 
 
 
324 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  45.28 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.43 
 
 
333 aa  235  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.93 
 
 
324 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  47.39 
 
 
319 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.87 
 
 
315 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  47.37 
 
 
321 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.81 
 
 
324 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  47.71 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  43.61 
 
 
320 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  48.03 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  48.03 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
322 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
328 aa  212  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.88 
 
 
241 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.15 
 
 
332 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
339 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  43.04 
 
 
329 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.09 
 
 
325 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.06 
 
 
341 aa  205  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  43.89 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
343 aa  199  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
318 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
341 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
323 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
336 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
326 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
320 aa  191  9e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
325 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.87 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.94 
 
 
327 aa  188  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
338 aa  188  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.81 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
331 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
339 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
307 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  43.93 
 
 
316 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  45.37 
 
 
317 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.95 
 
 
288 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
297 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
326 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.79 
 
 
289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  36.33 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
317 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
305 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.93 
 
 
312 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
327 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  42.72 
 
 
301 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  35.08 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.63 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.04 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  34.59 
 
 
352 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
303 aa  146  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
304 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 
303 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
307 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
300 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
303 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
305 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
300 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.03 
 
 
300 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
305 aa  142  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 
304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  39.61 
 
 
302 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.58 
 
 
303 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.01 
 
 
320 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
324 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  38.1 
 
 
299 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
308 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
305 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  44.5 
 
 
303 aa  136  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5484  predicted protein  43.81 
 
 
206 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0315179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  42.23 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  34.8 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  41.59 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
287 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  38.93 
 
 
320 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>