More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43764 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  100 
 
 
365 aa  768    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28998  predicted protein  37.23 
 
 
283 aa  162  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
269 aa  139  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  29.45 
 
 
257 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
257 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
288 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
281 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
268 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
259 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 
270 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
292 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0772847  normal  0.304058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 
287 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
285 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000468983  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 
259 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
326 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
304 aa  97.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 
340 aa  96.7  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00109277  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
292 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
300 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 
280 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.97 
 
 
281 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
298 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
286 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
286 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
300 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
300 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  30.23 
 
 
271 aa  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  31.74 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.244285  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  26.87 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
240 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
295 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
314 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 
305 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
349 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
320 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  31.78 
 
 
308 aa  89.4  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  30 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
319 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
289 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
289 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
289 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  31.53 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0384845  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
269 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  30.6 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  30.52 
 
 
300 aa  87  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.7 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
305 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2241  putative short chain dehydrogenase  25.99 
 
 
255 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.41 
 
 
279 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
288 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  29.05 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38463  predicted protein  27.9 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622688  normal  0.36197 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05400  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  27.7 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.580908  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.74 
 
 
290 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108282  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
324 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  29.15 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
291 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  29.49 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4187  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
288 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  27.02 
 
 
255 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  27.85 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  27.18 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  31.33 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  31.33 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  27.16 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  31.3 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  26.69 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>