More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2903 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.58 
 
 
273 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.51 
 
 
273 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.51 
 
 
273 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.84 
 
 
273 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.51 
 
 
273 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.66 
 
 
279 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  77.24 
 
 
247 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.03 
 
 
253 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.79 
 
 
248 aa  319  3e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.85 
 
 
246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.44 
 
 
246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
247 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  60 
 
 
247 aa  278  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
241 aa  198  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
263 aa  167  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 
260 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  37.8 
 
 
244 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
261 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
267 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  43.7 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.15 
 
 
248 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
252 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.8 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  36.95 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
248 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02721  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17650)  35.98 
 
 
260 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
252 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
260 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
247 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.16 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  37.7 
 
 
259 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
274 aa  133  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31135  Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 2  33.46 
 
 
250 aa  133  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
263 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
254 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
263 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
254 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
257 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
272 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  40.57 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  37.65 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  37.7 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.8 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
266 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.55 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.27 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
243 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  33.58 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  34.36 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.27 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  32.23 
 
 
240 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  37.65 
 
 
245 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  37.65 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
248 aa  125  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.62 
 
 
249 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
249 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
242 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.86 
 
 
250 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.06 
 
 
250 aa  125  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  34.23 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
232 aa  125  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.06 
 
 
246 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
246 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
251 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.25 
 
 
247 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
246 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.22 
 
 
250 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.96 
 
 
255 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
262 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
250 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  35.29 
 
 
250 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
262 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
248 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
248 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.36 
 
 
247 aa  123  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.24 
 
 
249 aa  123  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
260 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
256 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
253 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
246 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
246 aa  122  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>