More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1604 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.43 
 
 
246 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.02 
 
 
246 aa  324  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  66.67 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.14 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.73 
 
 
273 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
279 aa  307  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.83 
 
 
253 aa  301  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.79 
 
 
273 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.37 
 
 
273 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.37 
 
 
273 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.37 
 
 
273 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.5 
 
 
247 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  56.5 
 
 
247 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.54 
 
 
241 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
260 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
266 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
245 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
260 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.77 
 
 
263 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
248 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
248 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  35.92 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.03 
 
 
248 aa  135  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
260 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  40 
 
 
260 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  34.63 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  36.44 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
258 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02721  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17650)  33.21 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.679582  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
247 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
261 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
255 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
263 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  34.68 
 
 
246 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5135  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.96 
 
 
251 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
250 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  37.11 
 
 
259 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
243 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
251 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3647  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.8 
 
 
248 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
257 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  35.8 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.41 
 
 
246 aa  125  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
257 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
252 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
263 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
237 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
266 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.02 
 
 
249 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
249 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.57 
 
 
269 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
254 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
267 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
254 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.75 
 
 
249 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.59 
 
 
246 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
246 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
270 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.374056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  37.35 
 
 
259 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
273 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
262 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
268 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
272 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
247 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>