More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4814 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.84 
 
 
273 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  90.48 
 
 
273 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  94.51 
 
 
273 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.74 
 
 
279 aa  470  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  76.42 
 
 
247 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.03 
 
 
253 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.37 
 
 
248 aa  318  6e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.51 
 
 
246 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.09 
 
 
246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.17 
 
 
247 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  59.17 
 
 
247 aa  275  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
241 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
260 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
260 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
263 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  36.99 
 
 
244 aa  145  9e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
267 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  42.52 
 
 
260 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
245 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.19 
 
 
263 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
260 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  37.14 
 
 
246 aa  139  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
260 aa  138  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.27 
 
 
248 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
249 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
257 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  36.09 
 
 
259 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 
243 aa  132  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02721  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17650)  34.09 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.41 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
250 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
266 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
254 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
266 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31135  Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 2  32.3 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
263 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  36.9 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.2 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
254 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
257 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  38.11 
 
 
245 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  34.78 
 
 
252 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  36.03 
 
 
249 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
239 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.58 
 
 
248 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
254 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
237 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  37.25 
 
 
245 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
272 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
250 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  37.25 
 
 
245 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  30.99 
 
 
240 aa  123  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  38.08 
 
 
258 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
232 aa  123  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.68 
 
 
250 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
234 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1415  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.949681  normal  0.622645 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
254 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
249 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
246 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
242 aa  122  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  32.56 
 
 
253 aa  122  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
246 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  35.32 
 
 
250 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.89 
 
 
246 aa  122  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  38.22 
 
 
258 aa  122  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
260 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.89 
 
 
243 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.26 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  34.75 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.2 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  36.03 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.906179 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>