More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5233 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
279 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229534  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.74 
 
 
273 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.66 
 
 
273 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.74 
 
 
273 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.74 
 
 
273 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.74 
 
 
273 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.66 
 
 
273 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  73.98 
 
 
247 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.95 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16282  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.61 
 
 
246 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
246 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  59.58 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.58 
 
 
247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
241 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
260 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
263 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
260 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
261 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
248 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 
252 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.753255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  44.55 
 
 
260 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  37.3 
 
 
244 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
245 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
260 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
252 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_002950  PG2069  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 
243 aa  133  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
257 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02721  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17650)  34.98 
 
 
260 aa  132  5e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
247 aa  132  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
257 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  36.51 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.6 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
252 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.49109  normal  0.0150297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3863  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
250 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.385562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  35.92 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.22 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  37.25 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  38.11 
 
 
245 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.33 
 
 
243 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  37.25 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.752171  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  35.71 
 
 
259 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
242 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
256 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
263 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.6 
 
 
246 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
254 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  34.5 
 
 
253 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
253 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
248 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
254 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  38.13 
 
 
258 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  34.65 
 
 
252 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
246 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
241 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
255 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1182  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.06 
 
 
238 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.049347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  38.28 
 
 
258 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
274 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
234 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
250 aa  122  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
273 aa  122  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.815875  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  35.63 
 
 
249 aa  122  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
248 aa  122  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
246 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
248 aa  122  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
257 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  38.7 
 
 
251 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.17 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1682  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  33.46 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.98 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.906179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
249 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.26 
 
 
250 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31135  Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 2  29.96 
 
 
250 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
254 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
261 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.06 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1415  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.949681  normal  0.622645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>