More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0068 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
240 aa  481  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.05 
 
 
243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
259 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.91 
 
 
259 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2241  putative short chain dehydrogenase  51.57 
 
 
255 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2697  putative daunorubicin C-13 ketoreductase  50.98 
 
 
257 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114176  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 
257 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2020  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 
257 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07799  Uncharacterized oxidoreductase AN7799 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AV81]  40.78 
 
 
255 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.480251 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05368  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00440)  35.66 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43764  predicted protein  31.1 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10208  probable oxidoreductase  29.96 
 
 
271 aa  85.5  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1354  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.02424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.278197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  30.18 
 
 
242 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0471693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5377  putative retinol dehydrogenase  28.21 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.637386  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.512596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1474  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  28.43 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.45819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.95 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
269 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
278 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  28.57 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  28.57 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.78 
 
 
278 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.77 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  25.62 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  25.65 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4028  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 
292 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.251041  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1268  chlorophyll synthase / NADPH-protochlorophyllide oxidoreductase  28.57 
 
 
328 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
214 aa  59.7  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2737  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420132  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.85 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00878668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  26.37 
 
 
309 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
266 aa  58.9  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 
265 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  25.23 
 
 
309 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
265 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
239 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1692  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00276459  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2313  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
259 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2012  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331463  normal  0.0268601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1409  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1649  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000294684  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.18 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612268  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  26.9 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2409  short chain dehydrogenase  27.85 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00187204  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  26.64 
 
 
309 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003017  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  29.15 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00557089  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.6 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.77 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1959  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 
276 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.21 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0720968  normal  0.127644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06177  3-oxoacyl- reductase  28.88 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0653597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2905  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00116832  normal  0.0773773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00989  3-oxoacyl- reductase  28.88 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4285  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.75 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28998  predicted protein  28.52 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2199  short chain dehydrogenase  25.6 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321431 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  29.02 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  24.49 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
247 aa  55.5  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.439694  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.18 
 
 
248 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  29.08 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01247  short chain dehydrogenase  26.76 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01257  hypothetical protein  26.76 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.04 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>