More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3288 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3017  short chain dehydrogenase  81.15 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  81.15 
 
 		 260 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1896  short chain dehydrogenase  81.08 
 
 		 260 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  80.62 
 
 		 260 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2067  short chain dehydrogenase  74.23 
 
 		 260 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0224014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1448  short chain dehydrogenase  73.08 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.213081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  72.69 
 
 		 261 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1985  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1568  short chain dehydrogenase  71.54 
 
 		 301 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  70.38 
 
 		 258 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  69.62 
 
 		 258 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1566  short chain dehydrogenase  70 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  68.46 
 
 		 258 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1147  short chain dehydrogenase  68.46 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1263  short chain dehydrogenase  68.46 
 
 		 270 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4607  short chain dehydrogenase  69.23 
 
 		 260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1387  short chain dehydrogenase  68.08 
 
 		 258 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1347  short chain dehydrogenase  67.69 
 
 		 258 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0980  short chain dehydrogenase  68.85 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1440  short chain dehydrogenase  68.85 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1462  short chain dehydrogenase  68.85 
 
 		 260 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2612  short chain dehydrogenase  67.82 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1692  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.749857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1557  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1115  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00652763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0943  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1870  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0823567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0218  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0481209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1716  short chain dehydrogenase  66.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 		 259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.92 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 		 255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 253 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.24 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 253 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1212  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.54 
 
 		 253 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.18 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.777235  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.31 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  0.558071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.807197  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  43.7 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.91 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35950  putative dehydrogenase  45.82 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00392824  hitchhiker  0.00000000000000176535 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2794  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.98 
 
 		 255 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.02 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0981  2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase, putative  40.16 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 255 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0918  putative 2-deoxy-d-gluconate 3-dehydrogenase  40.16 
 
 		 249 aa  168  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.311873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  35.34 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  38.67 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  39.77 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  39.61 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.64 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  38.22 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  39.76 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  36.54 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  36.33 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  35.77 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  37.69 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  37.89 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  36.06 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  36.19 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.38 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1811  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.780661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0809  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1794  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.503189  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.72 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2073  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.844507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1100  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.410014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>