More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1151 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.27 
 
 		 206 aa  211  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.138611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1457  hypothetical protein  42.06 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1526  hypothetical protein  41.59 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.110275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0735  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.965519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1267  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.139748 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1469  short-chain dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.927324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1598  putative oxidoreductase protein  36.68 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 234 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0229  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02810  hypothetical protein  36.16 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.52 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1086  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002919  short chain dehydrogenase  38.7 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0979  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.4 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2690  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.909495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36622  Predicted short chain-type dehydrogenase  31.33 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0124  short chain dehydrogenase family protein  34.84 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.635136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 231 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0036356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0705  short-chain dehydrogenase/reductase  33.93 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.096337  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2459  csgA protein  35.65 
 
 		 231 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.54228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2239  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  35.02 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07571  short-chain dehydrogenase/reductase  33.04 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.36 
 
 		 230 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1408  short-chain dehydrogenase/reductase family protein  34.23 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.417919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.79 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707447  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01071  Short-chain dehydrogenases of various substrate specificities  34.23 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.315767  normal  0.657338 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07551  short-chain dehydrogenase/reductase  32.59 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  35.96 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.97281  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0139  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07591  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  34.55 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.85459  normal  0.0309227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0766  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.89 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0676  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3702  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01860  Short chain dehydrogenase family protein  33.48 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203928  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3129  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.424112  normal  0.883846 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3390  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.47762 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08791  short-chain dehydrogenase/reductase  32.88 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4186  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 238 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0670  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.620328  normal  0.485565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0107  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.950091 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32277  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.741112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35363  predicted protein  31.8 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.267844  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32278  putative short chain dehydrogenase  32.42 
 
 		 255 aa  99  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3270  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03037  hypothetical protein  37.57 
 
 		 193 aa  98.2  9e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.49 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0125  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.330397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0133  short chain dehydrogenase  31.72 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2584  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.567266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0177  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 248 aa  95.9  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0275  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0287555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0460  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 225 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.790746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 238 aa  94.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1087  short-chain dehydrogenase/reductase  33.64 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.236682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0592  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0632  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000159867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 		 250 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2943  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122274  normal  0.0405726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 279 aa  92.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2314  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2928  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0722078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4256  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10348  predicted protein  33.51 
 
 		 193 aa  91.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6271  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 		 229 aa  91.3  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4571  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000728936  hitchhiker  0.00656486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.198058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>