More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4451 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
251 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00605708  decreased coverage  0.00179082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1485  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
325 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
302 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.637306 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2247  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.08 
 
 
560 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1140  hypothetical protein  30.65 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
303 aa  72  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1729  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.98 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000357423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
357 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.9 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.603916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  0.388948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1472  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
334 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0018885  normal  0.965057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.688935  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0576  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
326 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19740  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.86 
 
 
263 aa  64.7  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1610  putative UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 
299 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0125  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
325 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 
300 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.386325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
321 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.49 
 
 
309 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
302 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
324 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
298 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642611  normal  0.440352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13505  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  28.07 
 
 
364 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.047646  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 
282 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.858296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  30.3 
 
 
321 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.759613  decreased coverage  0.00160839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
333 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
320 aa  59.7  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  31.33 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.17 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
322 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.87 
 
 
366 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
324 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
297 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  33.13 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  0.0188791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.3 
 
 
301 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.73675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.33 
 
 
330 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
297 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0188901  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.43 
 
 
311 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.125961 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  31.76 
 
 
327 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.92 
 
 
319 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
332 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2833  putative UDP-glucose 4-epimerase  26.36 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0483  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00129402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
321 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11128  cholesterol dehydrogenase  31.52 
 
 
370 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
295 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477522  normal  0.0234327 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
303 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
328 aa  55.8  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1800  hypothetical protein  27.89 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388037  hitchhiker  0.000742601 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  26.97 
 
 
328 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
311 aa  55.5  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  25.81 
 
 
384 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 
694 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.86 
 
 
308 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  25.68 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
325 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5547  UDP-glucose 4-epimerase  27.64 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4109  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.62 
 
 
331 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4185  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
371 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0437586  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  31.75 
 
 
340 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05364  hypothetical protein  27.53 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.024551 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
349 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3587  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
326 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4866  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 
328 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  28.32 
 
 
332 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>