270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1956 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1956  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 271 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.606516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.81 
 
 		 271 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2567  putative sulfolipid biosynthesis protein  80.44 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.93 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 		 301 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.77 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  30.19 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2573  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.48 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0706  putative epimerase/dehydratase family protein  32.46 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.48 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  32.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.8 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0715  epimerase/dehydratase family protein, putative  31.94 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186861  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.62 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 285 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  30.55 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  33.19 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.93 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.28982  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  30.9 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9273  putative oxidoreductase  30.91 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  35.06 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  30.56 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  hitchhiker  0.0000234209 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1471  hypothetical protein  28.79 
 
 		 830 aa  56.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  28.94 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.6 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  28.28 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5694  hypothetical protein  36.99 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.704204  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.26 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  28.05 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1844  UDP-glucose 4-epimerase  29.44 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 307 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5788  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.68 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0424  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.32 
 
 		 306 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.21 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  30.34 
 
 		 334 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.48 
 
 		 304 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  26.79 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6119  hypothetical protein  27 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.99 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0823  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  23.53 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  30.97 
 
 		 327 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 		 312 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0661585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1998  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.95 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000898814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1272  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0174113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  27.86 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  32.3 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.24 
 
 		 286 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0588  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  22.67 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.749225 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  32.24 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  31.01 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3156  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.83 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.272239 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.444146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 321 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2019  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.51 
 
 		 738 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.240233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3388  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0422  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 466 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 466 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.657654  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  29.56 
 
 		 327 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 		 466 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2812  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 		 326 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3531  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  27.89 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44260  NAD dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 		 325 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>