More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3503 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.304457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  91.45 
 
 
305 aa  557  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.18 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.29 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.7 
 
 
273 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.726437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1956  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.21 
 
 
271 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.307434  normal  0.606516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2567  putative sulfolipid biosynthesis protein  44.14 
 
 
271 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 
271 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3941  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.438556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  31.27 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.33 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.21169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.89 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00013526  normal  0.0975355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
368 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2946  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0355882  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0612  UDP-glucose 4-epimerase  32.39 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.520934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.4 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.69 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  34.1 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  30.79 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3129  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.43 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.33 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3093  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5446  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  32.54 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 
510 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0579282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3152  UDP-glucose 4-epimerase  36.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0601377  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3092  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.43 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.4 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3001  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.89 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.364672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
349 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1840  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.109062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2765  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.36 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3938  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1108  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.73 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1481  epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469702  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  30.36 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  32.57 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.83 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.96 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000177376  hitchhiker  0.0000622856 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2938  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  28.33 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  32.24 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  29.55 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3247  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.78 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
328 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3069  UDP-galactose-4-epimerase  27.61 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  32.97 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  32.07 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  34.59 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  33.14 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  31.49 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0026  epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
351 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  26.84 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.34 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  33.13 
 
 
337 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3016  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.78 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  31.43 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1265  UDP-galactose-4-epimerase  29.88 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3248  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.78 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  34.24 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36890  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  35.43 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.578301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0227  UDP-glucose 4-epimerase  30.9 
 
 
351 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0501438  normal  0.38802 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.15 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  26.42 
 
 
328 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>