More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2947 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2763  oxidoreductase-like  96.29 
 
 
375 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.495555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2947  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
375 aa  725    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.59536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2855  oxidoreductase domain protein  99.47 
 
 
375 aa  721    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0639382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  37.57 
 
 
368 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  28.18 
 
 
352 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  28.65 
 
 
680 aa  116  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3438  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 
363 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0315  oxidoreductase domain-containing protein  39.39 
 
 
694 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.596905  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
385 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  35.06 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2359  dehydrogenase and related protein-like protein  27.81 
 
 
695 aa  89.7  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0324247  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0290  oxidoreductase-like  29.35 
 
 
379 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0348948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  30.42 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  24.92 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1572  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
368 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  30.21 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  29.45 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  31.13 
 
 
346 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1602  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.86 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  24.25 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0466  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5216  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647839  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1024  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.85 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.33 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  35.68 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  30.39 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.52 
 
 
349 aa  77  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  26.22 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1545  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.31 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.547484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  42.25 
 
 
361 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.93 
 
 
458 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  29.51 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  25.4 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  38.42 
 
 
359 aa  76.3  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4405  oxidoreductase domain-containing protein  38.56 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0571768  normal  0.145119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  33.11 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2218  oxidoreductase-like  35.86 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  33.99 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  33.5 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.85 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  34.38 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  28.02 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  36.05 
 
 
382 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  40.52 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  32.47 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 
374 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2547  oxidoreductase domain-containing protein  32.87 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  0.311461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  28.34 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  40.26 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 
345 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5479  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.245476 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.59 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0112  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  35 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0136  oxidoreductase domain-containing protein  24.82 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000686096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1564  oxidoreductase domain-containing protein  28.63 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  33.75 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0465  oxidoreductase domain-containing protein  30.14 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0993329 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  24.54 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  34.16 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0787  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  33 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  33.12 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  28.06 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2585  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0150917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0294  oxidoreductase domain-containing protein  24.22 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.950002  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 
345 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.25 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  34.01 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2966  oxidoreductase domain protein  33.77 
 
 
699 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  34.01 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  24.61 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  32.19 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  31.66 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0887  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.523237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  27.97 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2141  oxidoreductase domain protein  30.07 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  34.67 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3454  oxidoreductase domain-containing protein  35.71 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  22.41 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  34.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  34.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  31.61 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05260  predicted dehydrogenase  30.49 
 
 
474 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  34.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  34.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  34.01 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>