More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3819 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 462 aa  957    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  58.81 
 
 		 455 aa  538  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  55 
 
 		 458 aa  522  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  45.18 
 
 		 451 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  37.2 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  36.5 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  33.4 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  34.13 
 
 		 421 aa  210  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 		 476 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  33.17 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.12 
 
 		 436 aa  196  9e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  31.26 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  33.41 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  31.61 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  30.45 
 
 		 445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29.78 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  29.47 
 
 		 469 aa  167  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  31.86 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 		 447 aa  160  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  30.42 
 
 		 424 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  29.38 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  26.65 
 
 		 490 aa  149  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  26.82 
 
 		 478 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  34.44 
 
 		 481 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.22 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.39 
 
 		 459 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.19 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  33.76 
 
 		 476 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  28.34 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  30.84 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  23.42 
 
 		 452 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  26.81 
 
 		 432 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  25.75 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  27.94 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  26.91 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 468 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.49 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  30.31 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  22.65 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.4 
 
 		 406 aa  94  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  29.81 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 364 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  30.09 
 
 		 350 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  30.09 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4339  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222851  hitchhiker  0.0000148603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 350 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.54 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.18 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.01 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  26.41 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  31.36 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  25.07 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.35 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  31.17 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4563  oxidoreductase domain-containing protein  25.96 
 
 		 496 aa  76.6  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.05 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2103  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1396  oxidoreductase domain-containing protein  31.45 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.31 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>