More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1843 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 447 aa  934    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  45.72 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  45.09 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  44.49 
 
 		 448 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  42.63 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  42.32 
 
 		 440 aa  335  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  41.4 
 
 		 445 aa  316  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 483 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  27.69 
 
 		 436 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 455 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  30.49 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  28.73 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.9 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.66 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  27.02 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  25.93 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  25.25 
 
 		 476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.12 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 		 447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  32.13 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  25.66 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 		 446 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 481 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  24.88 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  27.73 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 499 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.28 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.79 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  26.58 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  31.6 
 
 		 484 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  30.14 
 
 		 444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  24 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  26.62 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 		 473 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.48 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  24.21 
 
 		 462 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  32.62 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  31.1 
 
 		 444 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.26 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 478 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  23.81 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  22.39 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  24.87 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  23.4 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.1 
 
 		 362 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.8 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  21.96 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  21.84 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  21.75 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  24.09 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  22.49 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  24.53 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  32.31 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.79 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  22.71 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.84 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  25.84 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.06 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  25.36 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  25.84 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4623  oxidoreductase domain-containing protein  30.41 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  23.93 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  26.83 
 
 		 351 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>