More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2883 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 468 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  35.95 
 
 		 444 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  33.4 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  32.53 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  35.28 
 
 		 499 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  34 
 
 		 490 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  33.26 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  32.26 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 473 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  34.24 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  31.18 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  32.41 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  27.87 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  29.23 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  27.7 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 436 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 		 439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.72 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.95 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  25.64 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  24.69 
 
 		 471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.07 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 477 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 432 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 421 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 		 435 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 448 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  24.72 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.1 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.57 
 
 		 437 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.88 
 
 		 480 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  24.73 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  23.93 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 		 485 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 		 462 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 457 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 458 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.09 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  31.65 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.47 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  26.6 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.84 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 		 462 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  24.14 
 
 		 447 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 501 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.88 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  25.72 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  29.84 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  29.66 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  22.8 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  31.71 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  23.87 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.33 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3547  oxidoreductase domain protein  26.8 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.277566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  33.91 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  30.77 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.22 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  25.11 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.95 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  26.02 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  29.71 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  24.42 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  24.44 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  26.11 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  26.23 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>