More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3712 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 451 aa  940    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  39.21 
 
 		 436 aa  314  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 		 449 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  32.48 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  34.34 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 477 aa  227  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  32.07 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  33.47 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  33.9 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  30.13 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 434 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  30.5 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  29.5 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  28.42 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  30.79 
 
 		 501 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.21 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 		 457 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 451 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 434 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  26.83 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 		 499 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.6 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.01 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  24.95 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  26.11 
 
 		 447 aa  130  7.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  26.46 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  25.34 
 
 		 484 aa  126  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  28.81 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 447 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.36 
 
 		 485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  32.33 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 462 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 446 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  27.04 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  25.57 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 468 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  23.54 
 
 		 444 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.11 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  26.47 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  28.23 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.17 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  25.74 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  28.87 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  28.05 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 362 aa  79.7  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  37.58 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  29.02 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  27.38 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  23 
 
 		 359 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.1 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  29.48 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.95 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5587  Glucose--fructose oxidoreductase  24.16 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.258736  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  23.99 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0394  oxidoreductase domain protein  21.04 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  27.6 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06170  oxidoreductase, putative  26.32 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  33.62 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  29.33 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  28.04 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2956  oxidoreductase-like  28.75 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4425  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01557  glucose-fructose oxidoreductase  25.78 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.82 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>