More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6559 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 464 aa  970    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  57.94 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6637  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  59.48 
 
 		 435 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3260  oxidoreductase domain protein  52.74 
 
 		 449 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0260407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3812  oxidoreductase domain protein  52.17 
 
 		 451 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2701  oxidoreductase domain-containing protein  41 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2535  twin-arginine translocation pathway signal  41 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2602  twin-arginine translocation pathway signal  40.79 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  39.19 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  40.13 
 
 		 459 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  40.34 
 
 		 459 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1194  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  41.39 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.37 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  40.13 
 
 		 459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  39.92 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  39.92 
 
 		 459 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  38.2 
 
 		 467 aa  309  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0017  oxidoreductase domain protein  37.21 
 
 		 481 aa  269  8.999999999999999e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  34.32 
 
 		 471 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3265  oxidoreductase domain protein  34.15 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0920  oxidoreductase domain protein  35.81 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.746532  normal  0.6877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1286  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  33.54 
 
 		 461 aa  239  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0256  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0165707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  34.65 
 
 		 474 aa  237  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0664  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.02 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0605  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  32.37 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.953329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5867  Alpha-N-acetylgalactosaminidase  31.07 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326374  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0808  oxidoreductase domain protein  24.11 
 
 		 367 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  31.9 
 
 		 406 aa  86.7  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 		 403 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  29.08 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  29.85 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  37.58 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  33.17 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  35.33 
 
 		 462 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4289  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  30.57 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  38.81 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0510  oxidoreductase domain protein  23.04 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  34.21 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.36 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  33.5 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  30.54 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.64 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 		 345 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  33.54 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  26.85 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  31.85 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 		 469 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4700  oxidoreductase domain protein  19.95 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  26.63 
 
 		 457 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.02 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2811  oxidoreductase-like  34.4 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116586  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  30.05 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  23.99 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  28.74 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5258  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  29.58 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0329  oxidoreductase-like  32.54 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25460  predicted dehydrogenase  23.17 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182103  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.29 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.7 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  25.3 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  26.41 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  28.92 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.1 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  27.81 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.66 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.1 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.28 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4444  oxidoreductase domain-containing protein  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122065  normal  0.178322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2026  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  26.37 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5485  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.863826  normal  0.176545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2927  putative dehydrogenase  29.27 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311728  hitchhiker  0.00000297483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0871  oxidoreductase-like  31.25 
 
 		 319 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.635047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  26.71 
 
 		 353 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  32.74 
 
 		 384 aa  57  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2703  4-carboxy-2-hydroxymuconate-6-semialdehyde dehydrogenase  32.26 
 
 		 319 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>