More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4311 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  100 
 
 
437 aa  915    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  46.73 
 
 
451 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  48.4 
 
 
440 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  46.44 
 
 
448 aa  408  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  45.62 
 
 
457 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  45.72 
 
 
447 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  43.12 
 
 
445 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  38.8 
 
 
435 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  35.96 
 
 
434 aa  269  8.999999999999999e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
480 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  31.74 
 
 
483 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  30.41 
 
 
448 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.59 
 
 
436 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
458 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 
462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  28.61 
 
 
501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  30.33 
 
 
451 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  29.55 
 
 
476 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 
455 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 
435 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  28.31 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
439 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  34.74 
 
 
499 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
447 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.16 
 
 
436 aa  157  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  34.88 
 
 
483 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  35.31 
 
 
490 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  33.22 
 
 
476 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 
481 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  30.56 
 
 
449 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  28.1 
 
 
484 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
471 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
428 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 
477 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  27.42 
 
 
435 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  27.99 
 
 
464 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  35.13 
 
 
444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.1 
 
 
444 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  28.6 
 
 
451 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  29.52 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30.33 
 
 
459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  26.32 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 
462 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.09 
 
 
469 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  28.3 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
485 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  26.34 
 
 
441 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 
444 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
446 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  24.56 
 
 
452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
468 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.43 
 
 
450 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
424 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
423 aa  103  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  25.06 
 
 
458 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  27.3 
 
 
452 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
478 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  23.09 
 
 
421 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  31.18 
 
 
459 aa  100  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  25.41 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.92 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 
460 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.24 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  27.55 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  33.12 
 
 
362 aa  87.4  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  26.38 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  25.79 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  26.24 
 
 
358 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  26.63 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7903  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1003  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0233303  normal  0.550785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  24.51 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  28.3 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2462  oxidoreductase domain protein  24.39 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  28.67 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.26 
 
 
359 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.48 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0483  oxidoreductase domain protein  27.56 
 
 
368 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.24 
 
 
353 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  23.27 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  23.33 
 
 
359 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  23.17 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  22.97 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.2 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  36.07 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6559  oxidoreductase domain protein  27.36 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00136961  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  25.08 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>