More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2272 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  70.64 
 
 		 423 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 421 aa  874    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  71.43 
 
 		 424 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 		 421 aa  208  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 428 aa  186  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  30.91 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.83 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  28.6 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 		 471 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 		 477 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  31.84 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 		 432 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  34.55 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  32.67 
 
 		 481 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 483 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 473 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  29.56 
 
 		 499 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  33.67 
 
 		 476 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  32.39 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  30.38 
 
 		 490 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 451 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  34.7 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  25.78 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.16 
 
 		 469 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  29.27 
 
 		 478 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  31.65 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  26.75 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  24.58 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  25.21 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.54 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.97 
 
 		 462 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  30.9 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  25.49 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 		 459 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.09 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.26 
 
 		 501 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.56 
 
 		 450 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 445 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  22.55 
 
 		 457 aa  93.2  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 		 452 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  34.97 
 
 		 353 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  30.77 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  35.48 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  23.05 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  32.92 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1636  oxidoreductase domain-containing protein  30.51 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0346  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.33 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.75359  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  34.84 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.33 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01950  predicted dehydrogenase  35.06 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  27.03 
 
 		 459 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  21.84 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  31.01 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5288  oxidoreductase domain protein  27.52 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  29.96 
 
 		 336 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2255  oxidoreductase domain-containing protein  30.3 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  33.33 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  31.87 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.01 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.44 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0652  oxidoreductase domain protein  29.93 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  27.84 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.84 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  28.66 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  25.32 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3023  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5222  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.465619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  24.38 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.59 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5579  hypothetical protein  28.67 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  29.55 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  21.31 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>