More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3511 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
444 aa  924    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  50.45 
 
 
444 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  41.37 
 
 
483 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  44.74 
 
 
447 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  41.21 
 
 
476 aa  355  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  42.2 
 
 
499 aa  350  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  40.92 
 
 
490 aa  348  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  44.52 
 
 
444 aa  345  7e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  40.38 
 
 
473 aa  339  5e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  42.41 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  39.08 
 
 
481 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  38.7 
 
 
484 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  39.5 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  35.95 
 
 
468 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  32.33 
 
 
459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.86 
 
 
427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
464 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 
421 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  28.98 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  27.62 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 
435 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  26.04 
 
 
436 aa  146  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29.36 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25.32 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
459 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 
448 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.33 
 
 
451 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
434 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  29.07 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  27.96 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 
478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
447 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  23.69 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.8 
 
 
485 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  26.58 
 
 
445 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
423 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  29.67 
 
 
424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
462 aa  120  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  25.38 
 
 
462 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 
477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  26.69 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  31.5 
 
 
483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  23.85 
 
 
451 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  25.48 
 
 
460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  23.34 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  24.85 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.33 
 
 
480 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  32.18 
 
 
450 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  22.17 
 
 
458 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 
455 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  24.33 
 
 
501 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  28.46 
 
 
452 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.27 
 
 
406 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  29.34 
 
 
451 aa  94  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.44 
 
 
403 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  30.26 
 
 
432 aa  90.9  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  26.33 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
463 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  30.57 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  26.79 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  29.84 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.29 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2849  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1440  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 
459 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0866733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1375  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 
459 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00261241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2876  oxidoreductase domain-containing protein  35.17 
 
 
337 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  31.72 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  24.04 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  24.76 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  32.17 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1428  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3896  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
371 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  30.92 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4943  oxidoreductase domain protein  33.79 
 
 
341 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 
459 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.7 
 
 
331 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 
374 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  30.43 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2464  oxidoreductase domain-containing protein  26.45 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.570958  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  29.82 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.57 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  33.33 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>