More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2975 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
428 aa  884    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  38.14 
 
 
447 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  38.35 
 
 
445 aa  286  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  40.72 
 
 
452 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  37.59 
 
 
436 aa  272  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  39.95 
 
 
442 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  38.83 
 
 
419 aa  260  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  37.83 
 
 
435 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 
435 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  34.18 
 
 
425 aa  206  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
475 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
403 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
463 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  25.42 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  30.97 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.39 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  23.35 
 
 
435 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  24.24 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  25.85 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  24.18 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  25.55 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  23.56 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  22.86 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  23.7 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
441 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  23.19 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
480 aa  69.3  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0681  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.109969 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.77 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  26.55 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  25.14 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  26.07 
 
 
365 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  28.44 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  23.6 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.32 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.32 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  21.93 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  27.11 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  23.39 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  27.15 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29700  predicted dehydrogenase  27.43 
 
 
450 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.32 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  25.93 
 
 
331 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.32 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.32 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  26.73 
 
 
342 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  25.57 
 
 
359 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  26.73 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
349 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
356 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.06 
 
 
359 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1705  putative oxidoreductase  28.63 
 
 
444 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
459 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  28.23 
 
 
444 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3339  oxidoreductase domain-containing protein  25.94 
 
 
495 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  23.45 
 
 
458 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.34 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  29.87 
 
 
347 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.89 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  25.22 
 
 
337 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.03 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  31.68 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  24.55 
 
 
374 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1598  oxidoreductase domain protein  31.13 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.179583  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2134  oxidoreductase domain protein  23.26 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  27.46 
 
 
471 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
344 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.61 
 
 
355 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
445 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.55 
 
 
362 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 
403 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  26.69 
 
 
412 aa  60.1  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  29.01 
 
 
473 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  25.1 
 
 
330 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
354 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  24.04 
 
 
330 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  22.22 
 
 
366 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.26 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  23.56 
 
 
437 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.05 
 
 
342 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
457 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  29.22 
 
 
336 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  26.96 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4010  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  26.22 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  31.71 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>