More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3462 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  937    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  34.76 
 
 
481 aa  246  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  36.15 
 
 
435 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  34.33 
 
 
444 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  34.48 
 
 
483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 
447 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  32.2 
 
 
490 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  31.85 
 
 
487 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 
473 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  32.25 
 
 
499 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  31.98 
 
 
484 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  36.03 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  32.77 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  32.52 
 
 
476 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.94 
 
 
436 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  28.69 
 
 
427 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  29.38 
 
 
468 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 
476 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
436 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 
448 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 
485 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  27 
 
 
434 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 
428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  34.32 
 
 
462 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 
459 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  26.17 
 
 
421 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  24.6 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  31.29 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  24.74 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 
435 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
458 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 
462 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
462 aa  109  9.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  34.28 
 
 
428 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  28.11 
 
 
455 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  24.36 
 
 
477 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  26.82 
 
 
449 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  24.69 
 
 
469 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  29.54 
 
 
440 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.23 
 
 
464 aa  101  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 
432 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  29.62 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  25.15 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  24.81 
 
 
460 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  31.02 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  25.19 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  28.91 
 
 
478 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  27.18 
 
 
423 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 
457 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 
480 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.14 
 
 
450 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
448 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
501 aa  90.1  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 
445 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  27.03 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  24.76 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.92 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  42 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  26.51 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  28.7 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  31.21 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  32.97 
 
 
441 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  34.81 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  26.99 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05425  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633756  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  34.96 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  34.92 
 
 
389 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1039  oxidoreductase domain-containing protein  34.26 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.95 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  37 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.99 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  66.2  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  24.32 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  35.66 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  38.18 
 
 
360 aa  65.1  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  39.36 
 
 
366 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  32.85 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  37.32 
 
 
345 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  33.12 
 
 
339 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  37.32 
 
 
345 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  37.32 
 
 
345 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  37.32 
 
 
345 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  37.32 
 
 
345 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
377 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  34.31 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  33.65 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 
366 aa  63.2  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  24.48 
 
 
518 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  28.38 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  26.71 
 
 
355 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  32.84 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2364  oxidoreductase domain protein  38.32 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2532  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>