More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2196 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2196  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
444 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.300613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1740  oxidoreductase domain protein  49.01 
 
 
444 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3511  oxidoreductase domain-containing protein  44.52 
 
 
444 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  44.32 
 
 
447 aa  351  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3415  oxidoreductase domain protein  41.43 
 
 
499 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  42.17 
 
 
483 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4556  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 
490 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249745  normal  0.558006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6207  oxidoreductase domain protein  40.79 
 
 
476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0817  oxidoreductase domain protein  40.79 
 
 
481 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  42.53 
 
 
435 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2671  oxidoreductase domain protein  40.79 
 
 
484 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348002  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3649  oxidoreductase domain protein  39.59 
 
 
473 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1399  oxidoreductase domain protein  40 
 
 
487 aa  303  5.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.313156  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3462  oxidoreductase domain-containing protein  34.73 
 
 
459 aa  216  8e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.555329  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2883  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 
468 aa  209  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.523748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
448 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
436 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  30.68 
 
 
421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4732  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
427 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  27.98 
 
 
434 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 
435 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1792  oxidoreductase domain-containing protein  29.98 
 
 
449 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3819  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 
462 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  34.52 
 
 
459 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1237  oxidoreductase domain protein  29.17 
 
 
434 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.512498  normal  0.0351281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  28.57 
 
 
428 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  28.14 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2272  oxidoreductase domain protein  34.7 
 
 
421 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  28.12 
 
 
485 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  25.67 
 
 
464 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  33.59 
 
 
462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 
476 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1741  oxidoreductase domain protein  30.87 
 
 
462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 
436 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  27.29 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.9 
 
 
483 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  27.82 
 
 
439 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3204  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
478 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408535  normal  0.098886 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3712  oxidoreductase domain protein  30.39 
 
 
451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2975  oxidoreductase domain protein  31.34 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  27.37 
 
 
451 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  27.27 
 
 
437 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2673  oxidoreductase domain protein  31.37 
 
 
423 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.305971 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  31.07 
 
 
458 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0047  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  29.83 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  27.27 
 
 
501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  24.63 
 
 
457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  27.93 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4517  oxidoreductase domain-containing protein  30.96 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6533  oxidoreductase domain protein  28.46 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0946388  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  26.56 
 
 
477 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  25.05 
 
 
448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
447 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4329  oxidoreductase domain-containing protein  27.29 
 
 
469 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.803175  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 
428 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1352  oxidoreductase domain protein  24.41 
 
 
445 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2325  oxidoreductase  30.77 
 
 
450 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  30.83 
 
 
480 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.56 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  39.1 
 
 
463 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  32.74 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.97 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  37.96 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  26.7 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  38.69 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  31.7 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0889  oxidoreductase domain-containing protein  33.59 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.286617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  32.67 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  37.4 
 
 
356 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5058  oxidoreductase domain protein  30.7 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  32.12 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  41.8 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  32.64 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  34.44 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01200  predicted dehydrogenase  34.43 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  26.42 
 
 
389 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2138  oxidoreductase domain protein  32.45 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3178  oxidoreductase domain protein  37.33 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  28.31 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  32.03 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.09 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  35.83 
 
 
337 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  38.02 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.51 
 
 
381 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2082  oxidoreductase domain protein  29.53 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.584693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  31.76 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2240  oxidoreductase domain-containing protein  32.76 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  34.91 
 
 
358 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  25.7 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0403  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.44 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  23.55 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3112  oxidoreductase domain-containing protein  27.12 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0376308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>